أكدت وزارة التربية والتعليم والتعليم الفني، عدم وجود أي صلة لها بما تم نشره على المواقع الإلكترونية ومواقع التواصل الاجتماعىي بالحديث عن المدارس اليابانية، وما تضمنه من معلومات وبيانات أو تقدم تدريبات لأي من المُعلمين بخصوص هذه المدارس.
جدير بالذكر، أن الجهة الوحيدة المنوطة بالتعامل مع هذه المدارس هي موقع الوزارة الإلكتروني http://www.moe.gov.eg، ووحدة مشروع المدارس اليابانية في الوزارة (الصفحة الرسمية للمدارس المصرية اليابانية -ejs)على الفيس بوك الرسمي للمشروع.