حدد القانون رقم 12 لسنة 2022، الذي أصدره الرئيس عبد الفتاح السيسي، بإنشاء وتنظيم المجلس الصحى المصري، الأهداف المرجوة من وراء إنشاء المجلس وتنظيم طريقة إدارته عبر 3 جهات مختلفة واختصاصاته.
وفيما يتعلق بالأهداف، نص القانون على أن تنشأ هيئة عامة خدمية تسمى "المجلس الصحى المصرى"، يكون لها الشخصية الاعتبارية، وتتبع رئيس الجمهورية، ويكون مقرها الرئيس مدينة القاهرة، ويجوز للمجلس إنشاء فروع في المحافظات، وتعتبر إدارة الخدمات الطبية العسكرية للقوات المسلحة (الأكاديمية الطبية العسكرية، كلية الطب بالقوات المسلحة) أحد فروع المجلس.
وأضاف أن المجلس يهدف إلى تنظيم مجالات الصحة في مصر في نواحي التعليم مـا بعد الجامعي، التدريب التخصصي، التأهيل وتطوير المستوى العلمي والسريري للأطباء والعاملين في مختلف المجالات الصحية.
كما يستهدف المجلس على وجه الخصوص تطوير التدريب الطبي والصحي للأطباء والعاملين في مختلف التخصصات الطبية ولخريجي الكليات الطبية والصحية، واختيارهم للتحقق من استيفـائهم للتأهيل الكافي للممارسة الطبية والصحية الآمنة لضمان تحسين الخدمات الصحية في جمهورية مصر العربية، وفقا للسياسة الصحية والطبية العامة للدولة.
كما يستهدف تحقيق التكامل والتعاون في مجال التدريب الصحى بين المجلس والهيئات والمجالس العلمية المختلفة في مجالات التخصصات ذاتها داخل جمهورية مصر العربية وخارجها، لتحقيق المعايير الدولية للممارسة الصحية الآمنة، ولمسايرة المجلس للتقدم العلمي.