يعقد البرنامج في مركز الإسكندرية للدراسات الهلينستية بالتعاون مع مؤسسة "فاردينويانيس" اليونانية، وجامعة الإسكندرية، والبرنامج متاح لخريجي الجامعات للحصول على درجات الدبلوم والماجستير في مجال الدراسات الهلينستية في أربعة مجالات؛ هي التاريخ، والأدب، والفن والآثار والعمارة، والفلسفة والعلوم.
ويمكن للطلبة من خريجي قسم الآثار والدراسات اليونانية والرومانية التقديم للحصول على درجة الماجستير مباشرة، أما الطلبة غير المتخصصين فيمكنهم التقديم للحصول على الدبلوم المؤهل لدراسات الماجستير. وتستمر الدراسة في الدبلوم لمدة عام واحد، وتُدرّس خلالها المواد باللغة الإنجليزية.
ويدرس مركز الإسكندرية للدراسات الهلينستية حقبة هامة من تاريخ الإسكندرية؛ وهي الفترة التي أنشئت فيها الإسكندرية، وتمتد حتى نهاية عصر البطالمة، أي نهاية عهد الملكة كليوباترا، وهى حقبة تاريخية هامة لم تنل الاهتمام الكافي من البحث والدراسة، فهي تجسد أكثر من 700 سنة من التاريخ المصري اليوناني.