رفض الدكتور شوقى علام، مفتى الجمهورية، اعتماد بعض الباحثين الأزهريين على كتابات الكتاب المتطرفين كمراجع فى الدراسات العلمية، معتبرًا ذلك يمثل "مصيبة كبرى" لا تليق بعلماء الأزهر الشريف.
جاء ذلك خلال مناقشته لرسالة الدكتوراة المقدمة لكلية الشريعة والقانون من الباحث رضا على الفلاح، تحت عنوان " أحكام العمليات التفجيرية فى غير ميدان القتال، وتطبيقاتها المعاصرة، فى الفقه الإسلامى والقانون الجنائى".
وأشار علام فى اعتراضه إلى أن سيد قطب أحد منظرى جماعة الإخوان الإرهابية، والمؤسس الحقيقى لفقه الإرهاب المعتمد على تكفير المجتمع، فضلا عن تنظيمه لسياسة الاغتيالات وتدمير مؤسسات الدولة للخروج بالمجتمع من جاهليته على حد زعمه المتطرف، حسب قول المفتي.